层流净化工作台为产品或样品提供了工作空间，可保护其免受微生物等微粒污染。这是通过HEPA过滤器的洁净空气层流实现的，该空气经过工作区吹向用户和实验室。因此，基本的层流净化工作台无法为用户提供保护，使其免受化学危险或传染性物质（包括微粒或挥发性危险物以及气溶胶）的侵害。这种保护需要生物安全柜（在下面讨论）。

层流清洁台分为垂直和水平两种，根据使用方式的不同，它们具有不同的优势。垂直层流洁净工作台力跨越工作空间的HEPA过滤空气向下，并且是用于部件或装置组件，电子检测，壳体的加工设备，药物制备，或制备媒体有用的，例如。水平层流净化工作台的工作空间沐浴在经过HEPA过滤的水平层流中，通常用于临床或制药应用，或需要无菌，无颗粒的环境。

矛盾的是，将物体（例如盛有标本的容器）放置在层流通风橱内时，会触发气流变化，从而可能污染层流洁净工作台工作空间。即使是将手伸入层流中的简单动作（例如操纵样本，甚至只是将样本放置在工作空间中），也会干扰气流。这些事件被称为障碍物，会导致气流紊流，从而导致脏空气从实验室进入（称为反冲洗），并且颗粒数量急剧上升。某些层流罩具有特殊设计，可zui大程度地减少反冲洗。例如，沿着通风橱工作空间边缘的狭槽可以充当高速空气回流，从而减少了在阻塞期间将脏空气引入层流通风橱中。